Malonaqen được suy đoán là con của vua Aramatleqo do nhiều kỷ vật được tìm thấy cùng khắc tên của hai người[3]. Mẹ của ông được cho là vương hậu Amanitakaye (Nu.26), một người chị em với Aramatleqo[4][5]. Vương hậu Tagtal, chủ nhân của ngôi mộ Nu.45, có thể là vợ của ông[5][6].

Không rõ mối quan hệ giữa Malonaqen và vua kế vị Analmaye.